Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops6O88545 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops6O88545 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops6O88545 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms