Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cfdp1O88271 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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