Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp4O70480 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms