Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Opn1mwO35599 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Opn1mwO35599 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Opn1mwO35599 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms