Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atf6bO35451 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atf6bO35451 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atf6bO35451 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Atf6bO35451 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atf6bO35451 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atf6bO35451 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atf6bO35451 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atf6bO35451 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atf6bO35451 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atf6bO35451 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atf6bO35451 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atf6bO35451 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Atf6bO35451 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atf6bO35451 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atf6bO35451 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atf6bO35451 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atf6bO35451 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atf6bO35451 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Atf6bO35451 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atf6bO35451 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atf6bO35451 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atf6bO35451 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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