Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sh2d1bO35324 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sh2d1bO35324 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms