Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Casq1O09165 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Casq1O09165 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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