Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp35M0QWN7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms