Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm2035J3QP87 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms