Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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