Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Top6blJ3QMY9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Top6blJ3QMY9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Top6blJ3QMY9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Top6blJ3QMY9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Top6blJ3QMY9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Top6blJ3QMY9 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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