Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm3415J3QMS8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms