Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Gm6594J3QM43 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm6594J3QM43 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm6594J3QM43 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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