Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm21411J3KMS0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm21411J3KMS0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Gm21411J3KMS0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Gm21411J3KMS0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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