Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm21863J3KMP8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm21863J3KMP8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms