Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Paip1-202ENSMUST00000109203 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gm44792-201ENSMUST00000207008 1628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkx1-1G3UXB3 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 AC102689.1-201ENSMUST00000220511 1090 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkx1-1G3UXB3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms