Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M1F7CXU4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms