Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Zfp988F6VKC7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Zfp988F6VKC7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Zfp988F6VKC7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Zfp988F6VKC7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Zfp988F6VKC7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Zfp988F6VKC7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Zfp988F6VKC7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Zfp988F6VKC7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Zfp988F6VKC7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Zfp988F6VKC7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Zfp988F6VKC7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Zfp988F6VKC7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Zfp988F6VKC7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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