Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17555F6U8B9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17555F6U8B9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms