Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms