Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm20518E9Q548 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms