Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20425E9Q035 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20425E9Q035 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20425E9Q035 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20425E9Q035 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20425E9Q035 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20425E9Q035 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20425E9Q035 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20425E9Q035 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20425E9Q035 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20425E9Q035 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm20425E9Q035 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm20425E9Q035 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm20425E9Q035 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Gm20425E9Q035 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20425E9Q035 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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