Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms