Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms