Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17333C6EQI3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms