Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Phf11bB4XVQ1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms