Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Clrn2B2RVW2 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Clrn2B2RVW2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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