Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rrn3B2RS91 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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