Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf3B2RQG2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf3B2RQG2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf3B2RQG2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf3B2RQG2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf3B2RQG2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf3B2RQG2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf3B2RQG2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf3B2RQG2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf3B2RQG2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf3B2RQG2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf3B2RQG2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf3B2RQG2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf3B2RQG2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf3B2RQG2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf3B2RQG2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms