Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tmem238A9JSM3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms