Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms