Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Speer3W4VSP1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Speer3W4VSP1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Speer3W4VSP1 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Speer3W4VSP1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Speer3W4VSP1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Speer3W4VSP1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Speer3W4VSP1 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Speer3W4VSP1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Speer3W4VSP1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Speer3W4VSP1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Speer3W4VSP1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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