Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3550W4VSN7 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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