Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt27Q9Z320 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt27Q9Z320 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt27Q9Z320 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt27Q9Z320 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt27Q9Z320 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt27Q9Z320 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt27Q9Z320 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt27Q9Z320 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt27Q9Z320 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt27Q9Z320 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt27Q9Z320 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt27Q9Z320 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt27Q9Z320 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt27Q9Z320 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt27Q9Z320 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt27Q9Z320 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Krt27Q9Z320 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt27Q9Z320 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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