Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Vamp5Q9Z2P8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Vamp5Q9Z2P8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Vamp5Q9Z2P8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Vamp5Q9Z2P8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vamp5Q9Z2P8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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