Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mbd3Q9Z2D8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mbd3Q9Z2D8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms