Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lgr5Q9Z1P4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms