Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Syngr4Q9Z1L2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms