Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Pfdn5Q9WU28 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Pfdn5Q9WU28 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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Pfdn5Q9WU28 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pfdn5Q9WU28 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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