Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nek3Q9R0A5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms