Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ercc4Q9QZD4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ercc4Q9QZD4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ercc4Q9QZD4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ercc4Q9QZD4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Ercc4Q9QZD4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ercc4Q9QZD4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ercc4Q9QZD4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Ercc4Q9QZD4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ercc4Q9QZD4 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ercc4Q9QZD4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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