Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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SrfQ9JM73 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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SrfQ9JM73 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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