Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Crlf1Q9JM58 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Crlf1Q9JM58 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Crlf1Q9JM58 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Crlf1Q9JM58 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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