Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rabgef1Q9JM13 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rabgef1Q9JM13 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rabgef1Q9JM13 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rabgef1Q9JM13 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rabgef1Q9JM13 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Rabgef1Q9JM13 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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