Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dclk1Q9JLM8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Dclk1Q9JLM8 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms