Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ldb3Q9JKS4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms