Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms