Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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