Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim2Q9ESN6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim2Q9ESN6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trim2Q9ESN6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim2Q9ESN6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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