Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm37396-201ENSMUST00000191827 1495 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm33112-201ENSMUST00000193971 699 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ms4a4bQ9ES61 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms